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软物质物理研究取得新进展

作者:ag亚洲游戏集团官网网址 时间:2022-07-14 点击数:

(通讯员 赵蕴杰)近日,我院赵蕴杰教授与美国乔治华盛顿大学曾辰教授合作在软物质物理领域取得了新的研究进展,在《Briefings in Bioinformatics》(IF: 13.99,中科院1区)杂志发表题为“Prediction of allosteric druggable pockets of cyclin-dependent kinases”的综述论文。我院博士研究生宁尚波为该论文的第一作者,赵蕴杰教授和曾辰教授为论文的通讯作者,ag亚洲游戏集团为第一完成单位。全文链接:https://doi.org/10.1093/bib/bbac290

赵蕴杰教授团队长期研究软物质物理方向,揭示生物分子结构和功能的基本原理,设计基于物理和人工智能的特异性靶向抑制剂。该论文综述了周期蛋白依赖性激酶结构与抑制剂研究的进展与挑战,对激酶家族结合口袋的序列与结构特征做了细致的分析。在此基础上,团队利用分子动力学模拟、自由能精确计算和动力学复杂网络等物理模型定量分析抑制剂对激酶结构与功能的影响,可精确预测靶向结合位点与特异性抑制剂,为靶向激酶的药物研发提供了理论指导与科技支撑。


图1为激酶靶点结构与序列特征提取与分析;图2为分子动力学模拟与动力学复杂网络模型,定量计算激酶特异性靶点;图3为自由能精确计算模型,定量计算抑制剂与靶向口袋的结合能;图4为拉伸动力学模型,检验靶向抑制剂的合理性。

该工作得到国家自然科学基金面上项目、湖北省百人计划、ag亚洲游戏集团优秀青年团队和优博培育项目等的资助。


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